臭氧具有极强的氧化性质，它可以直接破坏病毒的核糖核酸或脱氧核酸并将其杀灭。臭氧也可以损伤细菌、霉菌类微生物的细胞膜，抑制其生长，并进一步渗透破坏膜内组织，直至细菌、霉菌类微生物死亡。臭氧气体浓度越高杀菌效果越好.
臭氧气体对瓶盖杀菌浓度推荐:在臭氧浓度为100mg/m3时，杀菌时间30分钟。
由于臭氧发生器杀菌需要的时间很长，对于具备一定生产能力的自动化饮料生产线来说，如果既要满足杀菌效果又要让瓶盖杀菌过程在杀菌设备内连续完成的话，杀菌设备需要做得非常庞大。实际生产过程中，瓶盖臭氧杀菌是在具备一定生产能力的自动化饮料生产线上，在较大的密封空间里放置一定量的瓶盖，然后对瓶盖所在的空间充填一定浓度的臭氧并保持一段时间。放置的瓶盖数量以维持生产所需瓶盖数量而定。杀菌后的瓶盖存放时间越长，受污染的危险越大，所以一般存放时间不超过一周。杀菌后的瓶盖需要与外界隔离，待输盖机需要瓶盖时送往输盖机。 目前，直接采用臭氧杀菌的独立设备多见于小型柜式瓶盖杀菌柜。这种瓶盖杀菌柜的杀菌空间小、生产能力小、间隔生产、非自动化。使用这种臭氧杀菌柜时，需要人工把杀菌瓶盖搬出杀菌柜放入输盖机，注意防止瓶盖二次污染。
高浓度臭氧水对瓶盖杀菌
高浓度臭氧水中存在不稳定元素，它们会自行分解。臭氧水杀菌就是利用这个分解过程（氧化过程）对物体表面的微生物进行氧化，从而达到杀菌目的。
常见的具有强氧化性的物质有：过氧乙酸、臭氧水和氯水，臭氧的瞬时杀菌性质优于氯。目前，饮料瓶盖杀菌的杀菌水基本采用过氧乙酸和臭氧水，其中绝大多数为过臭氧水。臭氧水杀菌无残留,水中臭氧浓度越大，需要的杀菌时间也相应缩短。对于水中10-30mg/L的过臭氧水，通过30秒～60秒时间杀菌，可以使瓶盖达到商业无菌的要求。由于臭氧水的杀菌时间短、杀菌效果好，被广泛应用于果蔬汁饮料的瓶和盖杀菌。利用高浓度臭氧水对饮料瓶盖进行杀菌的方式主要有喷冲式和浸泡式。
喷冲式
是采用多组喷嘴，对瓶盖的多个方向喷射高浓度臭氧水进行瓶盖表面杀菌，瓶盖接受喷射的时间应保证微生物能被完全杀灭。具体方法为：经过理盖后的瓶盖方向一致地进入瓶盖轨道，在轨道的上下方设有多组喷头，每组喷头可以从不同角度对瓶盖喷射高浓度臭氧水，喷射的高浓度臭氧水既对瓶盖进行杀菌也推动瓶盖沿着轨道前行, 利用臭氧水作为杀菌水时，由于臭氧水分解后的产物是水和氧气，不存在任何有害的残留物质，理论上无需对瓶盖再作处理，但实际生产过程中，由于瓶盖杀菌机出口与旋盖机距离很近，无法使残留臭氧完全分解，因此，瓶盖经过臭氧水杀菌后还需要经过无菌水冲洗和无菌空气吹干处理,
浸泡式
是把饮料瓶盖完全浸泡在杀菌水中，使瓶盖的所有内外表面都接受高浓度臭氧水杀菌，浸泡时间应满足瓶盖完全杀菌的时间要求。一种方法是：方向一致的瓶盖固定在瓶盖架上，瓶盖架连接在链条上，链条的运动带动瓶盖架进入装有高浓度臭氧水的杀菌池内并使瓶盖完全浸泡在杀菌水中，浸泡的时间应满足完全杀菌的时间要求。与喷冲杀菌方式一样，高浓度臭氧水浸泡后的瓶盖同样需要无菌水的喷洗和无菌空气的喷冲，使瓶盖既干燥又无菌。因此这种杀菌工艺一般应用于果汁饮料的无菌冷灌装。
中国饮料行业近十年达到了快速发展，饮料的卫生和安全得到了消费者越来越多的重视. 高品质,安全放心的饮料得到欢迎.在饮料包装中,瓶盖的杀菌很重要.传统的瓶盖杀菌采用氯制剂杀菌,而氯制剂是致癌物质,国家未来将禁止使用.采用臭氧发生器对瓶盖杀菌消毒,杀菌后又还原成氧气和水,因为没有任何残留.是高档瓶盖杀菌的重要杀菌设备.饮料的灌装方式包括冷灌装、热灌装、中温灌装、无菌冷灌装等。针对不同产品和不同的包装形式，都可以采用不同的用臭氧水杀菌方案来对包装物瓶盖的杀菌处理.臭氧对瓶盖杀菌有两种方式:臭氧气体对瓶盖杀菌, 臭氧水对瓶盖杀菌.瓶盖杀菌方式杀菌瓶盖适用的饮料对环境要求臭氧气体杀菌
1．采用大密封空间放置瓶盖充填臭氧气体.矿泉水、热灌装状态下的果汁饮料和茶饮料
万级无菌
不适用金属瓶盖杀菌
2．采用臭氧杀菌柜杀菌：小生产能力半自动化生产非无菌冷灌装饮料
臭氧水杀菌
1．喷冲式：矿泉水、热灌装状态下的果汁饮料和茶饮料
2．浸泡式：可用于所有饮料，更适合无菌冷灌装状态下的所有饮料
百级无菌
不适用金属瓶盖杀菌
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